MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 1257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	CAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015979	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015979	TA	3	6	52	57	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015979	GAAC	2	8	61	68	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015979	T	6	6	97	102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015979	ACT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015979	A	7	7	318	324	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
8	NC_015979	A	6	6	333	338	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
9	NC_015979	TCAA	2	8	356	363	50 %	25 %	0 %	25 %	347533701
10	NC_015979	ATA	2	6	377	382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
11	NC_015979	TAA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
12	NC_015979	ATC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533701
13	NC_015979	GAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533701
14	NC_015979	TAGA	2	8	617	624	50 %	25 %	25 %	0 %	347533701
15	NC_015979	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533701
16	NC_015979	GTA	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
17	NC_015979	A	6	6	827	832	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
18	NC_015979	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
19	NC_015979	T	8	8	899	906	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
20	NC_015979	T	6	6	936	941	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
21	NC_015979	AGTC	2	8	953	960	25 %	25 %	25 %	25 %	347533701
22	NC_015979	A	6	6	965	970	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
23	NC_015979	TAAT	2	8	1001	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	347533701
24	NC_015979	AAAC	2	8	1030	1037	75 %	0 %	0 %	25 %	347533701
25	NC_015979	ATACT	2	10	1109	1118	40 %	40 %	0 %	20 %	347533701
26	NC_015979	A	6	6	1149	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
27	NC_015979	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
28	NC_015979	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
29	NC_015979	TGA	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
30	NC_015979	ATG	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
31	NC_015979	TAAT	2	8	1433	1440	50 %	50 %	0 %	0 %	347533701
32	NC_015979	TTA	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
33	NC_015979	TGA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
34	NC_015979	TAA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
35	NC_015979	A	6	6	1566	1571	100 %	0 %	0 %	0 %	347533701
36	NC_015979	GGAAA	2	10	1574	1583	60 %	0 %	40 %	0 %	347533701
37	NC_015979	T	6	6	1680	1685	0 %	100 %	0 %	0 %	347533701
38	NC_015979	TGA	3	9	1746	1754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
39	NC_015979	TAGA	2	8	1757	1764	50 %	25 %	25 %	0 %	347533701
40	NC_015979	T	6	6	1827	1832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015979	ATA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015979	TAAA	2	8	1905	1912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015979	ATC	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015979	GAC	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015979	GAA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015979	AAG	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015979	ACT	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015979	TGG	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015979	A	6	6	2137	2142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015979	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015979	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015979	TGA	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015979	AAGTGA	2	12	2335	2346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015979	AAG	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533702
55	NC_015979	A	6	6	2386	2391	100 %	0 %	0 %	0 %	347533702
56	NC_015979	TTG	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
57	NC_015979	AGCA	2	8	2443	2450	50 %	0 %	25 %	25 %	347533702
58	NC_015979	GTT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
59	NC_015979	AC	3	6	2495	2500	50 %	0 %	0 %	50 %	347533702
60	NC_015979	TGAG	2	8	2561	2568	25 %	25 %	50 %	0 %	347533703
61	NC_015979	CAT	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533703
62	NC_015979	CG	3	6	2626	2631	0 %	0 %	50 %	50 %	347533703
63	NC_015979	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533703
64	NC_015979	ACTC	2	8	2647	2654	25 %	25 %	0 %	50 %	347533703
65	NC_015979	A	6	6	2684	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	347533703
66	NC_015979	GAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533703
67	NC_015979	AAC	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
68	NC_015979	AAC	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
69	NC_015979	AATTA	3	15	2822	2836	60 %	40 %	0 %	0 %	347533703
70	NC_015979	A	6	6	2891	2896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015979	A	7	7	2933	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015979	GTT	2	6	2964	2969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015979	A	6	6	2970	2975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015979	AATC	2	8	2982	2989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015979	ATA	2	6	3043	3048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015979	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015979	A	6	6	3185	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015979	ATT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015979	A	7	7	3212	3218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015979	T	6	6	3237	3242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015979	TCT	2	6	3295	3300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015979	CCA	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015979	TAA	2	6	3396	3401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015979	GAA	2	6	3415	3420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015979	TGTTTT	2	12	3450	3461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015979	ATAA	2	8	3462	3469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015979	T	7	7	3488	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015979	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015979	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015979	CTA	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015979	TTG	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015979	ACT	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015979	TAG	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015979	A	6	6	3792	3797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015979	TAGCAT	2	12	3814	3825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015979	TCT	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015979	T	7	7	3948	3954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015979	TTC	2	6	3959	3964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015979	ATA	2	6	3978	3983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015979	TTCC	2	8	3985	3992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015979	ATT	3	9	4032	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
102	NC_015979	CTT	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533704
103	NC_015979	ATGA	2	8	4098	4105	50 %	25 %	25 %	0 %	347533704
104	NC_015979	ATA	2	6	4148	4153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
105	NC_015979	GCA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533704
106	NC_015979	A	6	6	4165	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	347533704
107	NC_015979	ATA	2	6	4182	4187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
108	NC_015979	AAAAT	2	10	4206	4215	80 %	20 %	0 %	0 %	347533704
109	NC_015979	ATA	3	9	4223	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
110	NC_015979	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
111	NC_015979	T	6	6	4299	4304	0 %	100 %	0 %	0 %	347533704
112	NC_015979	T	6	6	4315	4320	0 %	100 %	0 %	0 %	347533704
113	NC_015979	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533705
114	NC_015979	CCT	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533705
115	NC_015979	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
116	NC_015979	CTT	2	6	4428	4433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
117	NC_015979	CT	3	6	4438	4443	0 %	50 %	0 %	50 %	347533705
118	NC_015979	TAA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533705
119	NC_015979	AAC	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533705
120	NC_015979	TAA	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015979	A	6	6	4627	4632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015979	TAATT	2	10	4647	4656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015979	CAT	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015979	CAA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015979	ACT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
126	NC_015979	TGT	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533706
127	NC_015979	CCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533706
128	NC_015979	ATG	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533706
129	NC_015979	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533706
130	NC_015979	TCA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
131	NC_015979	AAT	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015979	GAT	3	9	4950	4958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015979	TCG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015979	AAG	2	6	5172	5177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015979	AAG	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015979	CAA	2	6	5201	5206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015979	AAAAAT	2	12	5208	5219	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015979	TGA	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015979	A	7	7	5305	5311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015979	TAC	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015979	GT	3	6	5522	5527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015979	AGT	2	6	5555	5560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015979	TAAA	2	8	5565	5572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015979	AG	3	6	5602	5607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015979	TAAT	2	8	5660	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015979	GGAT	2	8	5699	5706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_015979	TGA	2	6	18922	18927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533722
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